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布魯克CT圖像形態(tài)學與密度學定量分析軟件-CTAn-新功能介紹

更新時間:2020-07-01點擊次數(shù):5691

納米CT圖像定量分析的過程中,相信大家都遇到過這樣的情況:很難找到一個合適的閾值來分割我們要分析的對象。尤其是對于顯微ct掃描樣品中的細微結(jié)構(gòu)而言,由于沒有足夠高的分辨率來表征,高分辨三維X射線顯微成像系統(tǒng)造成其灰度要低于正常值,局部高襯度X射線三維掃描襯度降低。這就對我們的閾值選取、個體分割造成了非常大的困難,尤其是動輒幾百兆,幾個G的三維CT數(shù)據(jù)。所以在進行閾值分割之前,各種濾波工具就被我們拿來強化對象,弱化背景噪音,以期能夠得到一個更準確的結(jié)果。

 

各向異性擴散濾波

新版中增加的一些特性,其中之一就是強大高效的濾波工具“AnisotropicDiffusion,各向異性擴散”。”各項異性”,顧名思義,就是在進行平滑處理時各個方向并不相同,僅就垂直于邊界的區(qū)域進行平滑處理,保持邊界不會變的模糊。“擴散”意味著強度沒有整體增加或減少,即沒有強度信號的產(chǎn)生或破壞:對密度測量有利。各向異性擴散濾波器在降噪和邊緣保持之間提供了很好的平衡。

 

分水嶺算法

在CTAn的形態(tài)學操作插件中,用戶現(xiàn)在可以為分水嶺算法定義容差,并采用H-minima變換以該容差值的動態(tài)強度抑制區(qū)域小值,將“黏連”在一起的對象區(qū)分開。接下來利用 Individualobject analysis插件,可以將采用不同顏色編碼的圖像保存到剪貼板,根據(jù)所選的特征,每個個體會被賦予一個灰度值。

歐拉數(shù)和連通性參數(shù)以前僅在3D綜合分析中可用,現(xiàn)在它們也可用于單獨個體的3D對象分析。此外,軟件調(diào)整了歐拉數(shù)的算法,解決負連接的問題。

 

局部取向分析

CTAn提供了一個新的插件來執(zhí)行局部取向分析,以一定半徑內(nèi)的灰度梯度的計算為基礎(chǔ),可進行2D或3D的分析。圖像A為CFRP材料的纖維取向分析。圖像B為人體椎骨切片,垂直的小梁以紅色顯示,而水平支撐小梁以藍色顯示,節(jié)點和斜結(jié)構(gòu)顯示綠色。

 

種子生長函數(shù)

CTAn中添加了種子生長函數(shù)。從ROI-shrink-wrap插件可以選擇Fill-out模式。該函數(shù)通過二值化區(qū)域內(nèi)部的一個種子來生長感興趣區(qū)域(VOI)。它從內(nèi)部填充而不是從外部收縮來創(chuàng)建VOI,在許多應用中非常有用的,例如,在進行胚胎細胞的分割(圖像C)時不誤選具有相似密度的其他軟組織。

文章來源:布魯克X射線部門

 

 

 

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